对性病淋巴肉芽肿的治疗越早越好，初期病人用药后，全身性症状可迅速消失，但局部淋巴结肿的愈合有限。晚期出现严重并发症后治疗困难，往往需行手术治疗。治疗方法包括全身治疗和局部治疗。全身治疗主要是及时应用抗菌药。常用的药手有：四环素0.5克，每6小时一次，连服3—4周。磺胺噻唑，首剂 4.0克，以后每6小时1.0克，连用3周。孕妇和儿童可选用红霉素，成年人0.5 克，每6小时一次，连服20日。晚期患者可采用横胺剂或抗生素与皮质激素(强的松)联合疗法，能减轻下腹疼痛，减少直肠分泌物和减轻纤维化。
局部治疗可外用高锰酸钾水清洗外阴，对未化脓者可帖10%鱼石脂软膏或用红霉素、磺胺类软膏。淋巴结软化有波动（脓肿）形成者可在损害上方穿刺吸引脓液，并在脓腔内注入磺胺溶液。切不可作切开术，因其不易愈合。对晚期出现阴道或直肠狭窄者，须定期作扩张术。直肠狭窄严重者需做直肠切除术。有包皮及阴囊橡皮肿者，亦可手术切除。局部病灶还可以用超声波、紫外线、红外线、X线等物理疗法。
